《中国生态农业学报》原名《生态农业研究》，1993年创刊，2001年更名。中国科学院主管，中国科学院遗传与发育生物学研究所和中国生态经济学学会主办，科学出版社出版。《中国生态农业学报》2012年起由双月刊改为月刊，国际标准大16开本。国内外公开发行，国际标准连续出版物号：ISSN1671-3990， 国内统一连续出版物号：CN13-1315/S，国内邮发代号：82-973，国外发行代号：Q1625。
《中国生态农业学报》报道农业生态学、生态经济学、生态学及农业资源与环境等领域创新性研究成果。主要刊登农业生态系统结构、功能、能量及物质循环、演替规律及稳定性以及土壤、施肥与植物营养、水资源及其高效利用、作物生理生态、农业高效栽培技术与机理、作物抗性生理生态、抗性育种、病虫害防治、资源优化配置及其效益分析、农业生态工程技术、无公害农产品生产技术、农业环境污染防治及农业可持续发展等方面的研究报告、研究简报及综述, 以及生态农业建设和生态农业示范区建设典型模式与典型经验等。
《中国生态农业学报》为中国期刊方阵双效期刊、中文核心期刊、中国精品科技期刊、中国科技论文统计源刊、万方数据库统计源刊、中国科学引文数据库源刊和中国期刊网统计源刊、CNKI中国期刊全文数据库源刊、《中国学术期刊文摘》源刊，并被国际农业生物学文摘(CABI)、美国化学文摘(CA)、哥白尼索引（IC）、美国乌利希国际期刊指南等国际数据库及检索单位收录。荣获第三届、第四届全国农业优秀期刊一等奖和首届北方优秀期刊奖, 连续三届获得河北省优秀期刊奖。
《中国生态农业学报》办刊以来，始终坚持报道中国生态农业的创新理论、方法与技术，及时刊发农业生态学及其相关领域的国内外最新研究成果和研究进展，让读者及时了解相关领域的最新研究成果，为作者提供尽早展示最新科研成果的园地，推动生态农业及农业学科领域发展。
欢迎国内外从事农业生态学、生态学、生态经济学及农业环境保护等领域科技人员、高等院校有关专业师生、农业及环境管理工作者和从事生态农业建设的技术人员阅读与投稿。